Backend

Backend (API)

Backend jest zbudowany w Node.js z użyciem Express, Mongoose i MongoDB.

Schemat danych Promotora

Pole	Typ	Opis
sequence	String	Sekwencja DNA promotora
geneName	String	Nazwa genu
organismName	String	Nazwa organizmu
organismType	String (enum)	Typ organizmu: Eukaryota lub Prokaryota
sequenceLength	Number	Długość sekwencji (obliczana automatycznie)
gcContent	Number	Zawartość GC w sekwencji w % (obliczana automatycznie)
geneFunction	String	Funkcja genu
ncbiAccession	String	Identyfikator NCBI
chromosome	String	Chromosom
dataType	String (enum)	Typ danych: Experimental lub Predicted
publicationAuthors	[String]	Lista autorów publikacji
geneLocation	Object	Obliczana automatycznie na podstawie dlugosci promotora i miejscu startu
createdAt / updatedAt	Date	Timestampy (automatycznie)

---

Endpointy API

Pobranie filtrów

GET /promotors - wyrzuca wyniki z bazy

• ?page - paginacja
• ?limit - limit wyników na stronę; defaultowo - 10
• ?[filtr]=[tekst] - przykładowo: dataType, organismType, geneFunction
• ?q=[tekst] - wyszukiwanie frazą

GET /promotors/filters - pobiera opcje filtrowania

POST /promotors - pozwala dodać rekord do bazy Przykładowe body:

{
  "sequence": "ATGCGTACGTTAGC",
  "geneName": "lacZ",
  "organismName": "Escherichia coli",
  "organismType": "Prokaryota",
  "geneFunction": "Beta-galaktozydaza",
  "ncbiAccession": "NC_000913.3",
  "chromosome": "1",
  "dataType": "Experimental",
  "publicationAuthors": ["Author1"],
  "geneLocation": "1"
}

POST /promotors/bulk - dodawanie w bulku Przykładowe body:

[
  {
    "sequence": "ATGCGTACGTTAGC",
    "geneName": "lacZ",
    "organismName": "Escherichia coli",
    "organismType": "Prokaryota",
    "geneFunction": "Beta-galaktozydaza",
    "ncbiAccession": "NC_000913.3",
    "chromosome": "1",
    "dataType": "Experimental",
    "publicationAuthors": ["Author1"],
    "geneLocation": "1"
  },
  {
    "sequence": "ATTTTTT",
    "geneName": "lacI",
    "organismName": "Escherichia coli",
    "organismType": "Prokaryota",
    "geneFunction": "Beta-galaktozydaza",
    "ncbiAccession": "NC_000913.3",
    "chromosome": "1",
    "dataType": "Experimental",
    "publicationAuthors": ["Author1"],
    "geneLocation": "1"
  }
]